Gülgonca, Farsça “gül” ve “gonca” sözcüklerinden oluşur; olası anlamı “gül goncası, henüz açılmamış gül”dür. Nişanyan Sözlük goncayı tomurcuk anlamındaki Farsça ġunca sözcüğüne bağlar ve sözcüğün toparlamak, top haline getirmek anlamındaki bir fiilden geldiğini açıklar. Kubbealtı Lugatı goncayı henüz açılmamış çiçek diye tanımlar; aynı sözlükte iki öğenin ters sıralandığı goncagül maddesi de vardır ve gonca biçiminde top gibi duran bir gül çeşidini anlatır. Nişanyan Adlar, Gonca adını tomurcuk anlamıyla kaydeder.
Goncagül daha bilinen bir ad olduğundan, Gülgonca ilk duyuşta onun ters çevrilmiş hâli gibi algılanır. Benzer isimler arasındaki Gonca ve Goncagül bu yakınlığı gösterir; Gülziba ve Gülara da gül ile başlayan Farsça kökenli adlardır.