Karabörü, kara ve börü sözcüklerinin birleşiminden oluşur. Kara, Ana Türkçe *kara (koyu, siyah) sözcüğünden gelir ve Vikisözlük'te esmer, koyu tenli anlamlarıyla da geçer; sözcük ayrıca erkek adı olarak kayıtlıdır. Börü, kurdun eski Türkçe adıdır: Osmanlıcada börü biçimiyle kullanılmış, Ana Türkçe *bȫrü'den gelmiştir; Eski Türkçede böri, Uygurcada böre, Kazakçada böri biçimleriyle yaşar. TDK adı esmer tenli ve işini iyi bilen kişi diye açıklar; işinin ehli olma anlamı köklerden doğrudan çıkmaz, TDK'nin yorumudur.
Benzer isimler arasındaki Atabörü, Kızılbörü ve Kırbörü aynı börü öğesini taşır; Karabörü de bunlar gibi kurdun eski adını yaşatır. Dört hecede okunur (Ka-ra-bö-rü); ilk iki hece kalın, son iki hece ince ünlülü olduğundan ekler ü'ye uyar: Karabörü'ye, Karabörü'nün. Uzun bir ad olduğu için bir ya da iki heceli soyadlarıyla daha dengeli durur.