Göktaş, Türkçe gök ve taş sözcüklerinden oluşur; Nişanyan Adlar anlamını “mavi taş, göktaşı” diye verir. Günümüz Türkçesinde göktaşı, uzaydan yere düşen katı cisim demektir; TDK sözlüğü de adı bu anlamla açıklar. Kaydın tarihî notu ise başka bir yöne işaret eder: on birinci yüzyıla ait Beyhaki Tarihi, Göktaş'ı Irak Selçuklularının önderi olarak anar. Nişanyan, adın bu eski kullanımda turkuaz ya da lacivert taşı anlamında olabileceğini düşünür.
Baltaş, Baytaş ve Baştaş gibi benzer isimler aynı taş öğesiyle kurulmuştur; Göktaş bu ailede renk bildiren gök öğesiyle ayrılır. Ad, ş ile kısa ve keskin biter.