Bozdoğan, Nişanyan Adlar'da yırtıcı bir kuşun adı olarak kayıtlıdır ve 14. yüzyılda bir Türk beyinin adı olarak geçtiği belirtilir. İkinci öğe Doğan, Togan, Toğan ve Tuğan biçimleriyle de kullanılan, eskiden beri en sevilen Türk adlarından biridir. Nişanyan'a göre geçmişte “yırtıcı kuş” anlamı ağır basarken, bugün bu ad daha çok “doğmak” fiilinden türemiş gibi algılanır. Bozdoğan'da ise kuş anlamı açıktır.
Bozdoğan, bir renk sözcüğüyle bir kuş adını birleştiren eski Türk adları kalıbındadır. Üç hecesi de kalın ünlülüdür. Ortadaki yumuşak g, iki ünlü arasında kaldığından hafif duyulur. Benzer adlardan Baydoğan, Başdoğan ve Gökdoğan aynı kuruluştadır; Balaban da yırtıcı bir kuş adından gelir.