Ataner'in ilk ögesi Atan'ın Türkiye'deki anlamı belirsizdir. Nişanyan Adlar'a göre Atan, Kazaklar arasında yaygın bir kişi adıdır ve orada “ilk çocuk” ya da “deve yavrusu” anlamına gelir; Türkiye'de ise “atış yapan” mı yoksa “ata” mı kastedildiği açık değildir. TDK adı “atan yiğittir” diye açıklar, ancak bu yorum Atan'ın kesinleşmiş bir anlamına dayanmıyor. İkinci öge er Türkçede “erkek, yiğit” demektir.
Atamer ile arasında yalnız bir harf farkı vardır; nüfus kaydında karışmaması için yazım kontrol edilmelidir. Alaner ve Acarer de er ile biten, Ataner gibi üç heceli adlardır.
