Yılşen, yıl ve şen sözcüklerinin birleşimidir. Yıl, Ana Türkçe *yïl'dan gelir ve on iki aylık zamanı anlatır. Şen'in kökeni ise şaşırtıcıdır: Vikisözlük'e göre sözcük Osmanlıca yoluyla Ermenice šen sözcüğünden alınmıştır. Türkçede neşeli, güler yüzlü anlamının yanında kalabalık ve bayındır, gelişmiş yer anlamı da taşır; Şen tek başına hem kız hem erkek adı olarak kullanılır. TDK'nin yorumuna göre ad, bütün yıl neşesini yitirmeyen birini anlatır.
Benzer isimler arasındaki İlşen, Pekşen ve Hepşen de şen öğesiyle kurulmuştur; İlşen ile Yılşen yalnızca ilk sesle ayrılır. İki heceli (Yıl-şen) adın son hecesi ince ünlülü olduğundan ekler e'li gelir: Yılşen'e, Yılşen'in. Türkçe karakter desteklemeyen sistemlerde ad Yilsen gibi görünebileceğinden, resmî yazımda ı ve ş harflerinin korunmasına dikkat etmek gerekir.