Paksan, pak ve san sözcüklerinden oluşan bir erkek adıdır. Pak, Osmanlıca yoluyla Farsça pâk sözcüğünden gelir; temiz, saf ve arı demektir. San, Osmanlıca üzerinden Ana Türkçe *sā- (saymak) fiilinden türemiştir; saymak anlamındaki say- ve sanmak fiiliyle akrabadır, ad, ün ve şöhret anlamlarını taşır. Birlikte “temizliğiyle ün salmış” anlamı çıkar; TDK de adı namusu ve dürüstlüğüyle tanınan kişi diye açıklar.
Benzer isimler arasındaki Aksan ses bakımından Paksan'a en yakın addır; Pakkan ve Pakman ise pak ile başlayan öteki adlardır. Pak-san diye iki hecede okunur ve kalın ünlülü ekler alır: Paksan'a, Paksan'ın. Kısa ve iki heceli yapısı, uzun bir soyadıyla dengeli durur.