Gencer, Nişanyan Adlar'da “genç adam” anlamıyla kayıtlıdır; ad, genç ve er (“erkek, yiğit”) sözcüklerinden kurulmuştur. Kaydın asıl ilginç yanı adın geçmişidir: Gencer, Kars ve Ardahan'da Karapapak ve Yerli toplulukların geleneksel Türkçe adlarından biridir. 1934'ten sonra ise yeni Türkçe adlar arasına da alınmıştır. Yani ad, dil devrimi döneminin önerdiği adlardan önce bu bölgede zaten kullanılmaktaydı.
Ç yerine c ile yazılması, adı Genç sözcüğünden ilk bakışta biraz uzaklaştırır; söyleyişte ise iki hecede, Gen-cer diye ayrılır. Er ile biten adlar soyadı uzun olduğunda bile toparlanmış durur. Benzer isimler arasındaki Gökçer ve Görker de aynı -er sonuyla kurulmuş erkek adlarıdır.