Gençağa, Türkçe genç ve ağa sözcüklerinden kurulmuştur; Nişanyan Adlar adı genç efendi diye çevirir. Nişanyan Sözlük'e göre genç, Eski Türkçede yavru, bebek anlamındaki kēnç sözcüğünden gelir; Moğolcada ailenin en küçük çocuğunu anlatan kence de Türkçeden alınmıştır. Ağa ise ağabey anlamında bir saygı hitabıdır ve sözlüğe göre 13. yüzyıl sonlarında Moğolca, Türkçe ve Farsçada aynı dönemde ortaya çıkar.
Nişanyan Adlar, Genç sözcüğünün çoğu zaman Genç Osman, Genç Ali gibi birleşik adların ilk öğesi olduğunu, ara sıra tek başına ad olarak da kullanıldığını not eder. Gençağa bu kalıbın bir örneğidir: ilk öğe yaşı, ikincisi saygınlığı anlatır. Benzer adlar içinde Başağa aynı ağa öğesini taşır; Gürboğa ve Dikboğa ise boğa sözcüğüyle kurulmuş üç heceli erkek adlarıdır.