Berksan, berk ve san sözcüklerinden oluşur. Berk eski Türkçede “sağlam, dayanıklı” anlamına gelir; san ise “ün, şan, sayılan değer” demektir. TDK sözlüğü adı “gücüyle bilinen kişi” diye açıklar. Nişanyan Adlar'a göre berk, pek sıfatının eski bir biçimidir ve 1930'larda dil devrimi döneminde yeni Türkçe adlar arasına eklenmiştir. Kayıtta ayrıca son dönem Osmanlı donanmasındaki Berk-i Satvet torpido gemisinin adının, aynı sesi taşıyan Arapça “şimşek” sözcüğüne dayandığı belirtilir.
Ünsüz kümesi rk ile s'nin yan yana gelmesi Berksan'ı sert ama kısa tutar. Berkman ve Berkkan gibi benzer isimler aynı ilk öğeyi paylaşır; aralarındaki fark ikinci parçanın anlamından gelir.