Müzehher, Arapça مزهَّر sözcüğünden gelir ve “çiçeklenmiş, çiçek açmış” anlamını taşır. Nişanyan Adlar adı çiçekli, çiçeklenmiş diye kaydeder; TDK sözlüğü de aynı anlamı verir. Kök, Arapçada “çiçek” anlamına gelen zehr sözcüğüdür; Osmanlı Türkçesindeki ezhar (çiçekler) sözcüğü de bu kökün çoğuludur.
Ortadaki h sesleri hızlı söyleyişte kaybolabildiğinden adın tam okunuşuna dikkat etmek gerekir: Mü-zeh-her. Ek alırken yazımı değişmez: Müzehher'in, Müzehher'e. Münevver, Müyesser ve Muattar da aynı yapıda, ortası çift ünsüzlü Arapça adlardır.