İsmail Mert, kökleri farklı iki adın birleşiminden oluşur. İsmail Arapça kökenlidir ve Nişanyan Adlar'a göre “Rab işitti” anlamına gelir; Tevrat'ta ve Kur'an'da geçen bu ad, Hz. İbrahim'in cariyesi Hacer'den doğan oğlunun adıdır. Tevrat onu Arapların atası olarak anlatır, İslam geleneğinde ise Hz. Muhammed'in ataları arasında sayılır. Mert ise Farsça kökenlidir, erkek ve yiğit anlamına gelir; Nişanyan'a göre 1930'lardan beri seyrek görülmüş, 1970'lerden itibaren giderek sevilen bir ad olmuştur.
Dört heceli birleşimde uzun İsmail önce, kısa ve sert biten Mert sonra geldiği için söyleyiş dengelidir: “is-ma-il mert”. Benzer isimler arasındaki İbrahim Mert ve Miraç Mert aynı ikinci adı kullanır; İsmail Eren ve İsmail Ege ise ilk adı korur.