Mustafa Kağan, Arapça kökenli bir adla eski Türk unvanını birleştiren bir erkek adıdır. Mustafa, "seçilmiş, seçkin" anlamıyla bilinir ve Hz. Muhammed'in lakaplarından biridir. Kağan ise eski Türk devletlerinde hükümdara verilen unvandır; hakan sözcüğüyle aynı kökten geldiği kabul edilir. Birleşim dinî bir adı Türk tarihine uzanan bir unvanla yan yana getirir.
Mustafa Kağan, 2025 yılının il yeni doğan listelerinde yalnız Afyonkarahisar'da yer alıyor. O yıl ilde 4 erkek bebeğe verilmiş ve listede 26. sıraya girmiş. Türkiye geneli sıralamada ya da nüfusta bu adı taşıyanlara ait verilerde ayrı bir kaydı yok.
On iki harf ve beş heceden oluşan ad "Mus-ta-fa Ka-ğan" diye okunur. Kağan'daki "ğ" önceki ünlüyü uzatır; ad bu nedenle günlük konuşmada "Kaan" gibi duyulur. Bu yüzden Mustafa Kaan ile karıştırılabilir; nüfus kaydında hangi yazımın seçildiği belgelerde tutarlılık için önemlidir. Benzer kalıpta Mehmet Kağan ve Muhammed Kağan da kullanılıyor.